Em um mundo onde a alquimia é uma ciência altamente desenvolvida, os irmãos Edward e Alphonse Elric cometem um ato proibido: tentar ressuscitar sua mãe através da transmutação humana. O experimento dá errado, fazendo com que Edward perca membros e Alphonse perca todo o corpo, ficando sua alma vinculada a uma armadura. Em busca de restaurar seus corpos, eles partem em uma jornada perigosa para encontrar a lendária Pedra Filosofal — mas o que era para ser uma busca pessoal logo se revela envolvida em conspirações, dilemas morais, guerra e sacrifícios que desafiarão o que significa ser humano.